Willy Buchel estava preso em Nagasaki no dia 9 de agosto de 1945, quando os Estados Unidos lançaram uma bomba, a segunda após a de Hiroshima, três dias antes.
O ex-prisioneiro de guerra exigia desde maio de 2015 uma compensação por danos morais, indicou à AFP seu advogado.
Após o acordo, o primeiro deste tipo entre o governo japonês e um ex-prisioneiro de guerra estrangeiro exposto à radiação atômica, Buchel receberá 1,1 milhão de ienes (8.800 euros).
Buchel estava detido em um campo a 1,7 quilômetro do local onde explodiu a bomba em Nagasaki e que matou 70.000 pessoas. Em Hiroshima 140.000 pessoas morreram.
Em 1950 voltou à Holanda, mas não teve uma cobertura médica completa como a dos sobreviventes japoneses.