O jornal citou um funcionário, que declarou que o chefe de gabinete da Casa Branca, Denis McDonough, havia recebido explicações do Pentágono sobre por que Carter estava utilizando sua conta de e-mail pessoal.
Desde 2012, o Departamento de Defesa proíbe que seus funcionários utilizem seus e-mails pessoais para tratar assuntos do ministério.
O porta-voz de Carter, Peter Cook, indicou em um comunicado que o uso do e-mail pessoal foi um erro, que foi corrigido posteriormente.
"Depois de revisar suas práticas de e-mail no início do ano, o secretário acredita que este prévio e uso ocasional do e-mail pessoal para temas de trabalho, inclusive para assuntos administrativos de rotina (...), foi um erro", indicou Cook.
"Como resultado, ele deteve o uso de seu e-mail pessoal e também se limitou a usar completamente seu e-mail (oficial)", acrescentou.
A revelação ocorre após o escândalo provocado por informações de que a candidata republicana à Casa Branca, Hillary Clinton, utilizou seu e-mail pessoal quando atuou como secretária de Estado do presidente Barack Obama.
Embora quase todos os funcionários de alto escalão do governo ocasionalmente usem seu e-mail pessoal para falar de trabalho, fontes oficiais indicaram ao The Times que Carter havia trocado informação sobre discursos, reuniões, entrevistas a meios de comunicação e outros assuntos.
"O secretário Carter prefere manejar suas comunicações por telefone ou pessoalmente, e como muitos de seus antecessores raras vezes utiliza o e-mail para assuntos oficiais do governo", afirmou Cook, minimizando as revelações do jornal.