O motim, que também resultou num incêndio, começou por causa de uma briga entre dois grupos encabeçados por líderes do cartel Los Zetas que disputavam o controle sobre o presídio.
"Exorto as autoridades mexicanas a garantir o direitos dos familiares de saber a verdade acerca do que aconteceu", cobrou o relator num comunicado.
Méndez também pediu para que sejam logo identificadas as nove pessoas mortas cujos nomes ainda são desconhecidos.
No dia do motim, centenas de pessoas, a maioria mães, esposas e irmãs de detentos, foram à prisão para conferir se seus familiares estavam bem.
As autoridades foram criticadas pela forma com que informaram o nome dos mortos identificados: pregando uma simples lista na parede, do lado de fora do presídio, provocando cenas chocantes de crises de nervos e desmaios.
O relator da ONU também solicitou atendimento médico de qualidade para os feridos.
"A investigação precisa levar também à reparação das vítimas e seus familiares, o que inclui as garantias de que tais fatos não se repetirão, além de melhorias substanciais nas condições de detenção", disse Méndez, que havia visitado o estabelecimento em 2014.
O relator denunciou o fato do presídio ter um "autogoverno e situações de violência", com sistema de "proteção de alguns detentos".
Depois do motim, autoridades encontraram em Topo Chico celas luxuosas, com sauna, ar condicionado e camas confortáveis.
A diretora foi detida, e 230 presos foram transferidos, entre eles os dois líderes que originaram o confronto.