O flagra das imagens da televisão foram decisivas para a suspensão, já que "os árbitros da partida não viram a agressão", explicou a FA em comunicado.
Alli ficará de fora das três últimas partidas na Premier League do Tottenham que está na vice-liderança da competição e enfrenta Cheslea, Southampton e Newcastle.
Os 'Spurs' têm poucas chances de conquistar o troféu nacional, já que o líder Leicester tem sete pontos de vantagem, com nove pontos a serem disputados.
"O jogador aceitou a suspensão, mas a achou excessiva, algo com que a Comissão Disciplinar não concordou", completou a FA.
"Estou decepcionado por ver minha temporada terminar assim, mas aprenderei com este erro e voltarei mais forte", lamentou Alli no Twitter.
Dele Alli, desconhecido até a última temporada, foi contratado pelo Tottenham junto ao modesto Milton Keynes (3ª divisão) e marcou 10 gols na Premier League e deverá defender a Inglaterra na Eurocopa-2016 (10 de junho-10 de julho).