Elas foram transportadas de ônibus na quarta-feira em uma operação coordenada pelo Crescente Vermelho sírio.
Um total de 250 pessoas foram retiradas das cidades de Madaya e Zabadani, ao noroeste de Damasco, cercadas pelos rebeldes, informou o Observatório Sírio dos Direitos Humanos (OSDH).
Outros 250 foram retirados das cidades de Fua e Kafraya, sudoeste de Aleppo, controladas pelo governo e também cercadas pelos rebeldes.
O OSDH destacou que algumas pessoas já chegaram à província de Latakia, na costa mediterrânea, dominada pelo regime.
As pessoas de Madaya e Zabadani foram transportadas para a província de Idleb, tomada pelos rebeldes, perto da fronteira com a Turquia.
Mais de quatro milhões de pessoas vivem em cidades cercadas da Síria ou em áreas de difícil acesso, sem privadas de comida ou remédios.
A difícil situação humanitária representa um grande obstáculo para o avanço dos frágeis diálogos de paz de Genebra entre o governo e a oposição.
Mais de 270.000 pessoas morreram na Síria desde o início do conflito em 2011.