"O suicida estava a pé e se explodiu perto do ministério", acrescentou Dawlat Waziri, um porta-voz ministerial.
O atentado foi reivindicado pelos talibãs.
O fotógrafo da AFP viu várias ambulâncias se dirigindo ao local da explosão, isolado pelo exército.
Mais cedo, dez civis morreram e 40 ficaram feridos em um atentado realizado perto de um mercado de Asadabad, capital da província de Kunar, leste do Afeganistão.
O objetivo do ataque era Haji Khan Jan, chefe de uma tribo contrária aos talibãs e que morreu na explosão, segundo testemunhas.
Estes ataques coincidem com as tentativas do Afeganistão, China, Paquistão e Estados Unidos de reativar negociações de paz com os rebeldes talibãs.